双脱氧法和化学测序法如何选择?

2024年01月26日 阅读量:79

第一代测序sanger法测序又称双脱氧法测序

双脱氧测序方法速度快。引物的复性和测序可在60~90之间 min 内部完成。可同时制备大量单链或双链测序样品。如果使用35 DNTP标有S标记 测序,可以提供优异的(电泳)条带分辨率。其主要缺点是模板的组成或二次结构有时会导致测序过早终止。虽然和Klenow 与片段相比,还有其他聚合酶可以缓解这个问题,但有些DNA 无法用双脱氧法准确测量序列。

化学法的主要优点是可以消除DNA 合成DNA的聚合酶 当遇到问题时,可以测量酶法无法测量的序列。此外,对于较短的DNA, 化学法不需要将其亚克隆到合适的测序载体上进行片段测序。最后,化学法是确定小分子质量寡核苷酸序列的唯一方法。虽然DNA准备用于测序 开发PSP64CS、PSP655等特殊载体需要很多时间,但现在需要很多时间 CS  ,亚克隆相邻待测序列的片段可以直接标记,未确定的单链末端可以标记,消除需要大量擦拭时间的胶水纯化步骤。这些载体的应用也实现了同时测序大量样品的目标,因为每个重组质粒的测序都是系统的。

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