当细胞裂解并释放内容物时，蛋白质水解酶和其他降解酶也一起释放。此时，蛋白质水解酶需要添加到裂解缓冲液中。PS: 细胞本身的蛋白质水解酶也会降解细胞中的蛋白质。
| 抑制剂 | 靶向蛋白酶 | 有效浓度 | 储存浓度 | 其他 |
| 抑蛋白酶肽 | 水解酶的丝氨酸蛋白 | 0.1-2ug/ml | PBS中溶解10mg/ml | 避免反复冻融 |
| EDTA | 水解酶的金属蛋白 | 0.5-2mmmol/L | 500mmol/L pH8.0水溶液 | |
| 亮抑酶肽 | 水解酶与苏氨酸蛋白 | 0.5-2ug/ml | 10mg/ml水溶液 | |
| α巨嗜球蛋白 | 广谱 | 1单位/ml | PBS中溶解100单位/ml | 避免还原试剂 |
| 抑胃酶肽 | 酸性蛋白质水解酶 | 1ug/ml | 1mg/ml溶于甲醇 | |
| 苯甲基磺酰氟 | 水解酶的丝氨酸蛋白 | 20-100ug/ml | 10mg/ml溶于异丙醇 | 现配现用 |
| 甲苯磺酰异亮氨酰氯甲酮 | 胰岛素 | 50ug/ml | 在50mmol/L的乙酸中溶解1mg/ml，pH5.0 | 胰凝乳蛋白酶不受影响 |
| 甲苯磺酰苯丙氨酰氯甲酮 | 胰凝乳蛋白酶 | 100ug/ml | 3mg/ml溶于乙醇 | 胰岛素不受影响 |
