《Plant Physiology》华北理工大学对现代榴莲基因组研究取得新突破

2025年02月11日 阅读量:319

元素百科华北理工大学在现代榴莲基因组研究方面取得了新的突破。近日,《Plant Physiology》王希胤的话题组题在网上发表“Recursive paleohexaploidization shaped the durian genome"研究论文。研究小组对榴莲基因组进行了重新分析,并与棉花、可可、葡萄基因组进行了比较,发现榴莲基因组的组成来自于独特的六倍事件和与其他双子叶植物共有的更古老的六倍事件;棉花独特的十倍事件。

据报道,多倍化在植物进化过程中是基因组测序在植物学领域的重要成就之一。多倍化在一定程度上解释了重要植物群体的发生、形成和快速分化。然而,确定多倍化的规模和对基因组的影响是一项极其复杂的工作,不足的分析可能会导致问题的研究结果。

榴莲“臭”名昭著,但因果肉营养丰富,享有“水果之王”的美誉。2017年榴莲(Durio zibethinus)发表了基因组测序,提出了榴莲和棉花共享基因组的双重事件,但没有明确多重事件的性质和规模。事实上,早期的研究表明,棉花有一个十倍体的祖先。榴莲基因组公布后,王希胤研究小组以葡萄和可可树为外部群体,对榴莲和进化相似的棉花基因组进行了重新分析。利用研究小组提出的植物复杂基因组的软件流程,对基因组间同源基因点阵图、共线性基因及相关进化事件进行了深入细致的分析-共有分析棉花共线性基因等。研究发现,榴莲和棉花除了近1.3亿年前双子叶植物共有的六倍化事件外,还经历了一个独立的多倍化事件:榴莲基因组经历了一个古老的六倍化事件,发生在1900-2100万年前;棉花基因组经历了1300-1400万年前的一个古老的十倍化事件。

王希胤研究小组的研究指出,分享多倍化事件的不正确结果可能解释为:首先,经过十倍化事件后,棉花基因组的进化速度加快,使得棉花基因的进化速度比榴莲高~64%; 榴莲的古六倍体事件并没有显著提高榴莲基因组的进化率,这可能与榴莲的长寿命有关。其次,植物基因组的高度复杂,之前的研究并没有有效地区分不同进化事件产生的基因。


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