各种成本都在增加，导致CMO原料药综合成本增加，国际市场价格竞争优势下降。
其次，我国CMO原料药的生产主要是技术含量较低的仿制CMO原料药， 而且我国CMO原料药的研发能力和规模也有限，导致CMO原料药产品附加值低。
同时，由于CMO原料药数量仍明显，CMO原料药质量、中国药典标准、行业标准、企业标准低于发达国家标准和要求，CMO原料药长期杂质和残留溶剂导致出口堵塞，影响CMO原料药的出口。
此外，中国CMO原料药生产企业也面临着严重的环境污染问题。CMO原料药的各种生产过程都会造成不同程度的环境污染，环境控制成本高，节能减排，迫切需要寻求新的发展模式。除了产品本身升级的压力外，中国CMO原料药的出口还面临着重要的管理和体系改进问题。
CMO原料药生产过程的监督和质量保证没有标准和完善的管理体系，导致CMO原料药生产在生产管理、人员配备、质量保证和过程监控方面存在不足， 会影响我国CMO原料药生产的整体质量和水平，阻碍CMO原料药行业出口市场的发展。同时，中国原材料行业缺乏相关专业人员，缺乏了解各目标出口国药品政策、技术标准和营销体系的专业人员，也对中国CMO原材料药品出口产生了一定的影响。我国CMO原料药出口的另一个重要问题是出口频繁受阻， 它给我的CMO原料药出口带来了巨大的影响和挑战。面对中国CMO原料药出口数量的不断增长，采取了不同程度的反倾销、反垄断和贸易壁垒政策，抑制了中国CMO原料药出口市场，抑制了中国在国际市场上的地位。cas号查询
