元素百科为您介绍科学家发表环形RNA研究综述。近日，中国科学院北京生命科学院计算基因组学实验室研究员赵方庆的研究综述文章以Computational为基础 strategies for exploring circular 以RNAS为题，在线发布在Trends in 在Genetics上。本文全面阐述了环形RNA研究和数据挖掘的多种方法，探讨了相关方法在非编码RNA数据挖掘中的应用条件和优缺点评价，指出了未来环形RNA数据挖掘的发展趋势和挑战。
环形RNA是近年来广泛关注的一种结构闭合环形RNA分子，并入选Clarivatete Analytics 2017年热点前沿领域。环形RNA具有多种基因来源、内部组成、细胞定位、生成机制和生物功能。深入研究高通量测序数据已成为该领域的必要途径。根据参考基因组的使用策略，现有的识别算法可分为基于分段比较（split-alignment based）并基于伪参考序列构建（pseudo-reference based）两类。由于比较算法类型的不同，每种识别算法分别针对剪切类型（splice-aware）和全能型（versatile）优化比较算法。另外，向后剪接读段（back-spliced junction read）这些识别算法在检测和配对终端比对信息的筛选中采用了不同的策略。上述关键步骤影响了不同转录组测序数据中识别算法的性能。目前，十多种环形RNA识别算法在敏感性、可靠性和应用范围上存在显著差异。
